
תצפית הנוף מהר פסגה מגלה את הארץ המובטחת, כפי שהיה עם משה: מים המלח דרך הרודיון, בית לחם וירושלים (46 ק"מ ממעוף הציפור) לפסגה של הלאלסנדריון ויריחו. בלילה ניתן לראות את האורות של הערים נוצצים. האתר, יחד עם
הבזיליקה החדשה והשרידים של המנזר הביזנטי הגדול, הינם תחת הטיפול של הקוסטודיה של ארץ הקודש.
לאחר הכניסה לאתר זה, לוחות הנצחה גדולים (6 מטר) מזכירים את ביקרו של יוחנן פאולוס השני לארץ הקודש בשנת 2000. מקדימה, ניתן לקרוא בלטינית: "ל ואב אחד לכל, הוא אשר מעל כל, פועל בכל ובתוך הכל" (אל האפסים ג:6). בצד הצפוני, מצד ימין, מתוארים נביאים מהתנ"ך, אשר "ראו" סצנות מהעתיד (האגרת הראשונה של פיטר א:10-12). בגב, "האל הוא אהבה" כתוב בערבית, ואשא הינה "הזמנה של מלכות השמים ומסר של הנביאים" לבסוף, בצד הדרומי, מצד שמאל, אנו קוראים שוב (הפעם ביוונית): "אלוהים הוא אהבה" (אגרת הראשונה של יוחנן ד:8). הסמל של הקוסטודיה של ארץ הקודש ניתן לראותו למעלה.
המוזיאון הקטן כולל מספר פריטים מינורים, בייחוד קרמיקות, המוצגות, בנוסף למספר מודלים ודגמים ושני אבני מייל של דרך רומית שהיו בין חשבון ל-ליביאס (כיום תל אר-ראמא, ליד מקום הטבילה בירדן) עוקף את הר נבו צפונה.
בטור המרכזי, בקבוצה של שלוש,העשוי משיש יקר בצבעים של שחור ולבן שמקורם ממחצבה קיסרית, שסביר להניח שהם מתנה מקיסר (קונסטנטינוס) לקהילה הנוצרית המקומית.
בבזיליקה מהתקופה הביזנטית, נמצאו פסיפסים בשלושה שכבות, ולעיתים אף ארבעה שכבות, המכסים סך כל שטח של 700מטר מרובע. הם נשמרו והופרדו וכמעט כולם כיום מוצגים בתוך הבזיליקה החדשה.
הבזיליקה החדשה
בתחילת שנת 1963, החלו לשקם מחדש את הבזיליקה, כשבתחילה לצורך הגנה פשוטה בבור השרידים של יד הזכרון המוקדשים למשה ומאוחר יותר (החל מ-2008) כך שישרת בו זמנית גם כמקום קדוש, מוזיאון ומקום מפלט לעתיקות.
העבודות שהושלמו בשנת 2016 הואטו ראשית על ידי מותו של הארכיאולוג והמנהל של האתר האח מיקלה פיצירילו ולאחר מכן על ידי פיתוח של טכניקות שימור חדשות או למעשה גילוי מחדש של טכניקות עתיקות של פסיפס. למעשה הוכח כי שיטות תיקון של הדבקה עם בטון שהיה נפוץ בשנות ה-60 וה-70 לטווח ארוך יזיקו ליצירה, בשעה ששיטת טיוח בסיד לוקחת יותר זמן אולם ארוכת טווח יותר.
הכנסייה החדשה הינה רחבה יותר מקודמתה הביזנטית, וכוללת חדרים נוספים וקפלות צדדיות. אולם, הפרסבטרי הלא רגיל עם שלושת חלקי הכנסייה, בצורה של תלתן הולמת למקורית. בשכבת האבן הנמוכה יותר (המקורית) אנו מציינים כי אלמנטים ארכיטקטוניים נעשו עם חומרים ממוחזרים מבנין קודם; למשל, בסיס של עמוד שכיום נמצא בהיפוך. לרוע המזל, אנו יודעים כמעט כלום על המבנה המקורי, בייחוד מכיוון שממצאים מתקפה זו מאד נדירים. היה יכול להיות זה מבנה פגני, או יד זכרון יהודי או שומרוני לכבודו של משה. למעשה, שרידים של כיתוב שומרוני נמצא, אולם זה כמעט
בלתי נתפס: הממצאים הללו נשמרים כיום במוזיאון של המכון הפרנציסקאני לחקר המקרא שבירושלים.
החלונות של האפסה, המתוארכים לגרסה הראשונה של "תחליף" של הכנסייה, מראה את משה ואת אהרן מצד שמאל עם
מים העולים מהסלע (שמות 17:1-6); במרכז, משה מתווך בעבור העם, נתמך על ידי אהרון ו-ר\קור (שמות 7:8-13); מצד ימין מותו של משה כאן בהר נבו.
במהלך העבודות, תגלית חשובה נמצאה והיא של קבר שמעום לא נעשה בו שימוש (משום שהוא רדוד מדי ואין בו סימני קבורה) ונתגלה במקרה במרכז הכנסייה. בעבור קבר זה, אלאבסטר ישן יותר (הרודיאני) של מונומנט נעשה בו שימוש מחדש. מומחים כמעט בטוחים לגמרי שהניחו את ידם על קברו של משה המתואר על ידי עולת הרגל אגריה:
,בכנסייה זו, היכן שממוקמת הבמה, הבחנתי באזור מוגבה יותר במקצת בגודל של קבר. שאלתי את הנשים הקדושים הללו אודות דבר זה, והם ענו – "כאן משהה הקדוש הופקד לידי המלאכים. מאז, כפי שכתוב [דברים ל"ד: 6], אף אחד לא יודע היכן קברו, ולכן היו אלה בודאי המלאכים".
הארגון מחדש של הפסיפסים, הקריטריון שלפיו עבדו: מריבוי שכבות הפסיפס, זה שנשמר הכי טוב או מקושט באופן עשיר הועבר למקומו המקורי. השאר של הפסיפסים נתלו על הקירות קרוב ככל האפשר, ולכן כמעט כל היצירות, השייכים לשלבים שונים של ההיסטוריה של הבנייה, מצאו מקום בבזיליקה החדשה.
פיסול מודרני

הפיסול המודרני הנראה בריבוע לפני הכנסייה שנבנתה בין השנים 1983-84 על ידי האיטלקי מפירנצה ג'יאן פאולו פנטוני: מלאך הנחושת עולה מעל משה במדבר וקשור למוט בצורת צלב. האמן מקשר את ההיסטוריה של התנ"ך יחד עם ההיסטוריה של הכריסטולוגיה, כפי שעשה כותר ספר ההתגלות יוחנן. במציאות, לא ברור היכן נחשי הנחושת הועלו במהלך יציאת מצרים, ואף לא הקרבה להר אור בסיוע לפתור את החידה.
ויסעו מהר ההר, דרך ים סוף, לסבוב את ארץ רדום; ותקצר נפש העם בדרך. וידבר העם באלהים ובמשמה, למה העליתנו ממצרים למות במדבר. כי אין לחם ואין מים ונפשנו קצה, בלחם הקלוקל. וישלח יהוה בעם, את הנחשים השרפים, וינשכו את העם וימת עם רב מישראל. ויבוא העם אל משה ויאמרו חטאנו, כי דברנו ביהוה ובך התפלל את יהוה יסר מעלינו את הנחש; ויתפלל מה, בעד העם. ויאמר יהוה אל משה, עשה לך שרף ושים אותו על נס והיה כך הנשוך וראה אותו וחי"
(במדבר כ"א: 4-9)
"וכמו שהגביה משה את הנחש במדבר, כך צריך שיורם בן האדם למען יחיו חיי עולם לכל המאמין בו"
(ספר הבשורה לפי יוחנן ג:14-15)