דמותו של יוחנן המטביל הקדוש קשורה מאד למדבר, מקום של חיי נזירות, וכמו כן גם לאור ההיסטוריה של עם ישראל - מקום שבו פוגשים את חסדו של האל. לפי דבריו של הנביא ישעיהו, המבשר את בוא המשיח יגיע מן המדבר.
ב-עין אל-חביס, כ-3 ק"מ מעין כרם, מונצח זכרו של המקום שבו יוחנן המטביל בילה את ימי ילדותו ואת השנים שהיוו הכנה לפעולתו הציבורית. הדיווחים הכתובים אשר הגיעו אלינו – יחסית מאוחרים – שומרים את ההיבט ההיסטורי המבוסס בשמו של המקום ובהריסות."עין אל חביס" משמעו "מעיין הנזיר": הגדרה אשר מזכירה בבירור את דמותו של המבשר, אב הטיפוס של הנזירות. הצלבנים בנו כנסייה ומנזר שם, על בסיס מה שכבר היה קיים. הדיווח הכתוב הראשון היה מאת אנונימי [פלוני אלמוני] במאה ה-12 אשר הותיר לנו אזכור קצר של הקפלה במדבר.
ז’אן זואלרט צייר אותם ב-1586 – כבר כהריסות אולם עדיין מרשימים וכתב: "לאחר ביקור בכנסיית הביקור, החלטנו להמשיך עוד מייל אחד או שניים, לבקר את המדבר שבו יוחנן המטביל הקדוש, הודרך ונוחם ע"י רוח הקודש, בילה את ילדותו עד ליום ההצהרה לעם ישראל, ההטפה על הטבילה ועל סליחת החטאים. כאשר הגענו למדבר זה, לאחר דרך קשה מאד ושביל מסוכן, נמלאנו בשמחה לראות את המקום כה צנוע ויפה, למרות שכעת לא היו הרבה עצים כמו בעבר ועדיין קשה וצורם ורחוק מכל מקום יישוב אנושי. המערה היכן שהקדוש שכן, נחוגה במזמור המושר בכנסייה ואשר מתחיל ב"אנטרה דזרטי….." וחקוק בסלע באמצע ובתחילת המדרון של ההר המכוסה בשיחים, ואשר מייד הופך לתלול, צופה למעמקי העמק שממול. המערה מאד גדולה מבפנים ובחלקה האחורי ישנו חלק מוגבה, הדומה למזבח, היכן שהקדוש נהג לישון. הכניסה הינה קשה וצרה, אולם מרגע שאתה שם, ישנו מעיין של מים מאד טובים,
אשר נקווים מלמטה ומלמעלה. מעל, ניתן לראות כנסייה ומנזר קטן, המכילים חלקי קירות מתפוררים (אי אל אס 82)
בשנת 1626, האב קווארזמי דיבר על כנסייה המוקדשת ליוחנן הקדוש (שם, 86), אזכור המציע כי הפרנציסקאנים בנו אותו מחדש או שחזרו אותו