Os franciscanos, ao longo dos oito séculos de permanência na Terra Santa, e em muitos países do Oriente Médio, deram vida a muitas obras de caráter social e assistencial. Dentre essas, existe a gestão dos Institutos para crianças que freqüentemente são confiadas a outras comunidades religiosas, que colaboram com os Frades. Existem casas de repouso e centros-médico-assistenciais para anciãos e existem, além disso, atividades ligadas à Custódia, mas não administradas diretamente por ela, como o Instituto da Sociedade Antoniana, em Belém.

Muito importante para os cristãos locais é também a Obra das Casas, que tem por objetivo ajudar as famílias, contribuindo para a solução dos problemas fundamentais de casa. Através de vários projetos de construção de habitações, são dados alojamentos gratuitos para numerosas famílias, se contribui com as despesas de aluguel de inúmeras outras famílias e se reestruturam as casas que estão em condições precárias.

Além disso, ao problema de instrução é oferecida ajuda através das Bolsas de Estudo para Universidade e programas que visam pagar as despesas de todo o ano escolar para as crianças. Enfim, os frades colocaram para funcionar laboratórios e oficinas de modo que sejam enfrentados todos os problemas de ocupação.